هدف الهيئة الرئيس هو أن تصبح منظماً للكهرباء والإنتاج المزدوج عالي الكفاءة والمقدرة التقنية في الوقت الذي يتم فيه تحول هذه الصناعة تدريجياً، وبعناية تامة، من وضعها الحالي كمرفق احتكاري متكامل رأسياً إلى مرحلة السوق التنافسية التي تزخر بالموردين ومقدمي الخدمة والمشترين ، وذلك من خلال عملية حذرة ومتدرجة لفصل النشاطات وإعادة الهيكلة . ويقع على الهيئة واجب حماية المصلحة العامة وحماية حق المستهلك في الحصول على خدمة كهربائية عالية الجودة ، آمنة ، يمكن الاعتماد عليها وذلك بأسعار اقتصادية مبنية على أسس معقولة , وفي الوقت نفسه فإن الهيئة يجب أن ترعى حقوق مقدمي الخدمة والمستثمرين في الحصول على عوائد اقتصادية مجزية على الاستثمارات المدروسة التي يقومون بها ، كما يجب عليها دعم نشوء بيئة ملائمة تشجع المنافسة الشريفة العادلة بين مقدمي الخدمات الكهربائية ، وترعى حق المستهلك في الاختيار بين مقدمي الخدمة المتنافسين


وتتلخص أهداف الهيئة كالتالي:

·   حماية المصلحة العامة وحماية حقوق المستهلكين في الحصول على خدمات كهرباء، وتحلية مياه، وإنتاج مزدوج، ذات جودة عالية، وآمنة،  يعتمد عليها،وتتوفر بأسعار اقتصادية معقولة.

·   الارتقاء بخدمات الكهرباء وتحلية المياه والإنتاج المزدوج التي تركز على العناية بالمستهلك وحماية حقه في الاختيار الحر بين مقدمي الخدمة المتنافسين .

·   تشجيع المستثمرين من القطاع الخاص على المشاركة في تطوير صناعة الكهرباء وتحلية المياه،  وحماية مصالحهم ، وتمكينهم من تحقيق عوائد اقتصادية عادلة على استثماراتهم.

·   تكوين إطار تنظيمي لصناعة الكهرباء وتحلية المياه يتسم بالوضوح ، والشفافية، والاستقرار، وعدم التحيز.

·   العمل على إيجاد بيئة مناسبة تشجع التنافس المشروع والعادل بين منتجي خدمات صناعة الكهرباء وتحلية المياه وكذلك بين مقدمي هذه الخدمات.